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POLR2B P30876

DNA导向RNA聚合酶II亚基RPB2 (EC 2.7.7.6) (3'-5'核糖核酸外切酶) (EC 3.1.13.-) (DNA导向RNA聚合酶II 140 kDa多肽) (DNA导向RNA聚合酶II亚基B) (RNA聚合酶II亚基2) (RNA聚合酶II亚基B2) (RNA导向RNA聚合酶II亚基RPB2) (EC 2.7.7.48)

蛋白质信息 (UniProt)

DNA导向RNA聚合酶II亚基RPB2 (EC 2.7.7.6) (3'-5'核糖核酸外切酶) (EC 3.1.13.-) (DNA导向RNA聚合酶II 140 kDa多肽) (DNA导向RNA聚合酶II亚基B) (RNA聚合酶II亚基2) (RNA聚合酶II亚基B2) (RNA导向RNA聚合酶II亚基RPB2) (EC 2.7.7.48)

P30876

功能描述

RNA polymerase II (Pol II)的催化核心组分,Pol II是一种DNA依赖性RNA聚合酶,以四种核糖核苷三磷酸为底物合成mRNA前体和许多功能性非编码RNA (By similarity) (PubMed:27193682, PubMed:30190596, PubMed:9852112)。Pol II介导的转录循环经历转录起始、转录延伸和转录终止阶段。在转录起始过程中,Pol II起始前复合物 (PIC) 被募集到DNA启动子,其中聚焦型启动子含有起始子 (Inr) 元件或在细胞类型特异性基因中发现的TATA框,而分散型启动子通常含有低甲基化CpG岛,常见于管家基因。一旦聚合酶从启动子逃逸,它就进入延伸阶段,在此阶段基于与模板DNA链的互补性,RNA被主动聚合。转录终止涉及RNA转录本和聚合酶从DNA上释放 (PubMed:27193682, PubMed:30190596, PubMed:9852112)。与最大亚基POLR2A/RPB1共同形成Pol II活性中心。将一个核苷酸附加到新生RNA的3'端,POLR2A/RPB1最可能贡献一个Mg(2+)配位的DxDGD基序,而POLR2B/RPB2参与第二个Mg(2+)离子的配位并提供赖氨酸残基,这些残基被认为促进进入的核苷酸与模板碱基之间的Watson-Crick碱基配对。通常,Mg(2+)离子引导5'核苷三磷酸与新生RNA前一个核苷酸的3'羟基形成磷酸二酯键,并消除焦磷酸。可逆的焦磷酸解反应可在高浓度焦磷酸下发生 (By similarity) (PubMed:30190596, PubMed:9852112)。可以通过3' -> 5'核酸外切酶活性校对新生的RNA转录本。如果错误掺入了一个核糖核苷酸,则会沿着模板DNA回溯并切割磷酸二酯键,释放错误掺入的5'-核糖核苷酸 (By similarity) (PubMed:8381534)。 {ECO:0000250|UniProtKB:A5PJW8, ECO:0000269|PubMed:27193682, ECO:0000269|PubMed:30190596, ECO:0000269|PubMed:8381534, ECO:0000269|PubMed:9852112}.; FUNCTION: RNA依赖性RNA聚合酶,以四种核糖核苷三磷酸为底物催化非编码RNA (ncRNA) 3'端的延伸。靠近3'端的内部ncRNA序列在单轮Pol II介导的RNA聚合反应中作为模板。可能降低抑制Pol II介导的基因转录的ncRNAs的稳定性。 {ECO:0000269|PubMed:23395899}.

亚细胞定位

Nucleus

关键词

3D-structure DNA-directed RNA polymerase Hydrolase Magnesium Metal-binding Methylation Nucleotidyltransferase Nucleus Phosphoprotein Proteomics identification