JMJD6 Q6NYC1

双功能精氨酸去甲基化酶和赖氨酰羟化酶 JMJD6 (EC 1.14.11.-) (组蛋白精氨酸去甲基化酶 JMJD6) (含JmjC结构域蛋白6) (含Jumonji结构域蛋白6) (赖氨酰羟化酶 JMJD6) (肽-赖氨酸5-双加氧酶 JMJD6) (磷脂酰丝氨酸受体) (蛋白PTDSR)

功能描述

双加氧酶，既可作为精氨酸去甲基化酶，也可作为赖氨酰羟化酶 (PubMed:17947579, PubMed:20684070, PubMed:21060799, PubMed:22189873, PubMed:24498420)。作为赖氨酰羟化酶，催化靶蛋白（如 U2AF2/U2AF65 和 LUC7L2）特定赖氨酸残基的 5-羟基化。通过介导 U2AF2/U2AF65 的 5-羟基化来调节 RNA 剪接，影响 U2AF2/U2AF65 的 pre-mRNA 剪接活性 (PubMed:19574390)。羟基化其自身 N 端，这是同源寡聚化所必需的 (PubMed:22189873)。通过在赖氨酸富集结构域翻译后修饰 LIAT1 从而抑制 LIAT1 的核仁定位，在核仁液-液相分离 (LLPS) 的调节中发挥作用 (By similarity)。除了肽酰-赖氨酸 5-双加氧酶活性外，可能还充当 RNA 羟化酶，如其结合单链 RNA 的能力所提示 (PubMed:20679243, PubMed:29176719)。也充当精氨酸去甲基化酶，优先去甲基化不对称二甲基化 (PubMed:17947579, PubMed:24360279, PubMed:24498420)。去甲基化 'Arg-2' 位的组蛋白 H3 (H3R2me) 和 'Arg-3' 位的组蛋白 H4 (H4R3me)，包括单甲基化、对称二甲基化和不对称二甲基化形式，从而在组蛋白密码中发挥作用 (PubMed:17947579, PubMed:24360279)。然而，组蛋白精氨酸去甲基化可能不是体内的主要活性 (PubMed:17947579, PubMed:21060799, PubMed:22189873)。与 BRD4 协作，以其活性形式与正性转录延伸因子 b (P-TEFb) 复合物相互作用，以调节聚合酶 II 启动子近端暂停释放，从而激活一大群基因的转录。在远端增强子（即所谓的抗暂停增强子）上，去甲基化组蛋白 H4R3me2 和 7SKsnRNA 的甲基帽，导致 7SKsnRNA:HEXIM1 抑制复合物的解离。去除抑制性标记后，复合物 BRD4:JMJD6 吸引并将 P-TEFb 复合物保留在染色质上，导致其激活、启动子近端聚合酶 II 暂停释放和转录激活 (PubMed:24360279)。去甲基化其他精氨酸甲基化蛋白，如 ESR1 (PubMed:24498420)。不具有组蛋白赖氨酸去甲基化酶活性 (PubMed:21060799)。胚胎发生过程中多种器官分化所必需。作为造血分化的关键调节因子：通过调节 U2AF2/U2AF65 的 pre-mRNA 剪接活性，为血管生成出芽所必需 (By similarity)。似乎为调节巨噬细胞细胞因子反应所必需 (PubMed:15622002)。 {ECO:0000250|UniProtKB:Q9ERI5, ECO:0000269|PubMed:15622002, ECO:0000269|PubMed:17947579, ECO:0000269|PubMed:19574390, ECO:0000269|PubMed:20679243, ECO:0000269|PubMed:20684070, ECO:0000269|PubMed:21060799, ECO:0000269|PubMed:22189873, ECO:0000269|PubMed:24360279, ECO:0000269|PubMed:24498420, ECO:0000269|PubMed:29176719}.

组织特异性

Highly expressed in the heart, skeletal muscle and kidney. Expressed at moderate or low level in brain, placenta, lung, liver, pancreas, spleen, thymus, prostate, testis and ovary. Up-regulated in many patients with chronic pancreatitis. Expressed in nursing thymic epithelial cells.

亚细胞定位

Nucleus, nucleoplasm