YTHDF3 Q7Z739

含YTH结构域家族蛋白3 (DF3)

功能描述

特异性识别并结合含有N6-甲基腺苷（m6A）的RNA，并调节其稳定性（PubMed:28106072, PubMed:28106076, PubMed:28281539, PubMed:32492408）。M6A是存在于mRNA内部位点和某些非编码RNA上的一种修饰，在mRNA稳定性和加工过程中起作用（PubMed:22575960, PubMed:24284625, PubMed:28106072, PubMed:28281539, PubMed:32492408）。作为mRNA稳定性的调节因子，通过与CCR4-NOT复合物或PAN3相互作用，促进含有m6A的mRNA降解（PubMed:32492408）。YTHDF旁系同源物（YTHDF1、YTHDF2和YTHDF3）共享含有m6A的mRNA靶标，并冗余地介导mRNA降解和细胞分化（PubMed:28106072, PubMed:28106076, PubMed:32492408）。作为I型干扰素反应的负调节因子，通过下调干扰素刺激基因（ISGs）的表达发挥作用：通过结合FOXO3 mRNA起作用（By similarity）。独立于METTL3介导的m6A修饰结合FOXO3 mRNA（By similarity）。还可以与YTHDF2合作作为mRNA稳定性的调节因子，通过结合含有m6A的mRNA并促进其降解（PubMed:28106072）。识别并结合含有m6A的环状RNA（circRNAs）；circRNAs是通过pre-mRNAs的反向剪接产生的，这是由跨越环化外显子的dsRNA结构促进的非经典剪接过程（PubMed:28281539）。通过在结合含有多个m6A修饰残基的mRNA时发生液-液相分离，促进相分离的无膜区室（如P-bodies或应激颗粒）的形成：多甲基化mRNA作为YTHDF蛋白结合的多价支架，并列其无序区域，从而导致相分离（PubMed:31292544, PubMed:31388144, PubMed:32451507）。由此产生的mRNA-YTHDF复合物随后分配到不同的内源性相分离无膜区室，如P-bodies、应激颗粒或神经元RNA颗粒（PubMed:31292544）。也可能识别并结合含有N1-甲基腺苷（m1A）的mRNA：通过结合IGF1R的m1A甲基化转录本并促进其降解，抑制滋养层细胞侵袭（PubMed:32194978）。 {ECO:0000250|UniProtKB:Q8BYK6, ECO:0000269|PubMed:22575960, ECO:0000269|PubMed:24284625, ECO:0000269|PubMed:28106072, ECO:0000269|PubMed:28106076, ECO:0000269|PubMed:28281539, ECO:0000269|PubMed:31292544, ECO:0000269|PubMed:31388144, ECO:0000269|PubMed:32194978, ECO:0000269|PubMed:32451507, ECO:0000269|PubMed:32492408}.; FUNCTION: 对HIV-1病毒具有一定的抗病毒活性：以核衣壳依赖性方式掺入HIV-1颗粒，并在下一轮感染中降低病毒感染力（PubMed:32053707）。可能通过结合HIV-1 RNA基因组上的N6-甲基腺苷（m6A）修饰位点，干扰病毒生命周期的这一早期步骤（PubMed:32053707）。 {ECO:0000269|PubMed:32053707}.

亚细胞定位

Cytoplasm, cytosol