YTHDF2 Q9Y5A9

含YTH结构域家族蛋白2 (DF2) (CLL相关抗原KW-14) (高糖调节蛋白8) (肾癌抗原NY-REN-2)

功能描述

特异性识别并结合含有N6-甲基腺苷（m6A）的RNA，并调节其稳定性（PubMed:24284625, PubMed:26046440, PubMed:26318451, PubMed:32492408）。M6A是存在于mRNA内部位点和某些非编码RNA上的一种修饰，在mRNA稳定性和加工中起作用（PubMed:22575960, PubMed:24284625, PubMed:25412658, PubMed:25412661, PubMed:32492408）。作为mRNA稳定性的调节因子，根据具体情况，通过与CCR4-NOT和核糖核酸酶P/MRP复合物相互作用，促进含有m6A的mRNA降解（PubMed:24284625, PubMed:26046440, PubMed:27558897, PubMed:30930054, PubMed:32492408）。YTHDF旁系同源物（YTHDF1、YTHDF2和YTHDF3）共享含有m6A的mRNA靶标，并冗余地介导mRNA降解和细胞分化（PubMed:28106072, PubMed:32492408）。含有RIDA/HRSP12结合位点（5'-GGUUC-3'）的含m6A mRNA优先通过核糖核酸内切裂解降解：RIDA/HRSP12和YTHDF2与转录本的协同结合导致核糖核酸酶P/MRP复合物的募集（PubMed:30930054）。其他含m6A的mRNA通过YTHDF2与CNOT1之间的直接相互作用进行脱腺苷化，导致CCR4-NOT的募集以及随后的含m6A mRNA脱腺苷化（PubMed:27558897）。母体需要其调节卵母细胞成熟：可能通过结合含m6A的mRNA起作用，从而调节卵母细胞成熟过程中的母源转录本剂量，这对卵母细胞维持早期合子发育的能力至关重要（By similarity）。在精子发生过程中也是必需的：通过促进编码基质金属蛋白酶的含m6A转录本的降解来调节精原细胞的粘附（By similarity）。还通过结合含m6A的mRNA参与造血干细胞的特化，导致促进其降解（PubMed:30065315）。还通过促进神经发育相关mRNA靶标的m6A依赖性降解，作为神经发育的调节因子（By similarity）。通过结合甲基化的神经特异性mRNA并促进其降解，抑制诱导多能干细胞的神经特化，从而限制神经分化（PubMed:32169943）。调节肝脏脂质代谢的昼夜节律调节：通过促进PPARA转录本的m6A依赖性降解起作用（PubMed:30428350）。通过抑制I型干扰素反应来调节对感染的先天免疫反应：通过结合含m6A的IFNB转录本并促进其降解起作用（PubMed:30559377）。也可能作为热休克应激后非帽依赖性mRNA翻译的促进因子：在应激下，重新定位于细胞核并特异性结合5'-UTR处带有某些m6A甲基化标记的mRNA，保护mRNA免受FTO去甲基化，从而促进非帽依赖性mRNA翻译（PubMed:26458103）。通过促进WEE1转录本的时相特异性m6A依赖性降解来调节有丝分裂进入（PubMed:32267835）。通过在结合含有多个m6A修饰残基的mRNA时发生液-液相分离，促进无膜区室（如P小体或应激颗粒）的形成：多甲基化mRNA作为YTHDF蛋白结合的多价支架，并置其无序区域，从而导致相分离（PubMed:31292544, PubMed:31388144, PubMed:31642031, PubMed:32451507）。由此产生的mRNA-YTHDF复合物随后分配到不同的内源性相分离无膜区室，如P小体、应激颗粒或神经元RNA颗粒（PubMed:31292544）。也可能识别并结合由C5-甲基胞苷（m5C）修饰的RNA，并作为rRNA加工的调节因子（PubMed:31815440）。 {ECO:0000250|UniProtKB:Q91YT7, ECO:0000269|PubMed:22575960, ECO:0000269|PubMed:24284625, ECO:0000269|PubMed:25412658, ECO:0000269|PubMed:25412661, ECO:0000269|PubMed:26046440, ECO:0000269|PubMed:26318451, ECO:0000269|PubMed:26458103, ECO:0000269|PubMed:27558897, ECO:0000269|PubMed:28106072, ECO:0000269|PubMed:30065315, ECO:0000269|PubMed:30428350, ECO:0000269|PubMed:30559377, ECO:0000269|PubMed:30930054, ECO:0000269|PubMed:31292544, ECO:0000269|PubMed:31388144, ECO:0000269|PubMed:31642031, ECO:0000269|PubMed:31815440, ECO:0000269|PubMed:32169943, ECO:0000269|PubMed:32267835, ECO:0000269|PubMed:32451507, ECO:0000269|PubMed:32492408}.; FUNCTION: (Microbial infection) 促进多瘤病毒SV40的病毒基因表达和复制：通过结合含有N6-甲基腺苷（m6A）的病毒RNA起作用（PubMed:29447282）。 {ECO:0000269|PubMed:29447282}.; FUNCTION: (Microbial infection) 在KSHV生命周期的某个阶段（在iSLK.219和iSLK.BAC16细胞中）促进卡波西肉瘤相关疱疹病毒（KSHV）的病毒基因表达和病毒粒子产生（PubMed:29659627）。通过结合含有N6-甲基腺苷（m6A）的病毒RNA起作用（PubMed:29659627）。 {ECO:0000269|PubMed:29659627}.

组织特异性

Highly expressed in induced pluripotent stem cells (iPSCs) and down-regulated during neural differentiation.

亚细胞定位

Cytoplasm, cytosol