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TET1 Q8NFU7

甲基胞嘧啶双加氧酶TET1 (EC 1.14.11.80) (CXXC型锌指蛋白6) (含CXXC结构域的白血病相关蛋白) (Ten-eleven translocation 1基因蛋白)

蛋白质信息 (UniProt)

甲基胞嘧啶双加氧酶TET1 (EC 1.14.11.80) (CXXC型锌指蛋白6) (含CXXC结构域的白血病相关蛋白) (Ten-eleven translocation 1基因蛋白)

Q8NFU7

功能描述

双加氧酶,在活性DNA去甲基化中发挥关键作用,通过催化修饰的基因组碱基5-甲基胞嘧啶(5mC)顺序氧化为5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)、5-甲酰胞嘧啶(5fC)和5-羧基胞嘧啶(5caC)(PubMed:19372391, PubMed:21496894, PubMed:21778364, PubMed:35798741)。除了在DNA去甲基化中的作用外,还通过招募组蛋白修饰蛋白复合物来改变组蛋白标记和染色质可及性,从而在染色质调节中发挥更广泛的作用,导致基因表达的激活和抑制(PubMed:33833093)。因此在许多生物过程中发挥作用,包括干细胞维持、T细胞和B细胞发育、炎症调节、基因组印记、神经活动或DNA修复(PubMed:31278917)。参与细胞多能性和谱系定向之间的平衡,并在胚胎干细胞维持和内细胞团细胞特化中发挥作用。与QSER1一起,在保护和维持转录和发育程序中发挥重要作用,以抑制DNMT3A/3B的结合,从而抑制从头甲基化(PubMed:33833093)。可能在发育过程中胰腺β细胞的特化中发挥作用。在此背景下,可能作为PAX4的上游表观遗传调节因子,推测是通过被FOXA2直接招募到PAX4增强子以保持其未甲基化状态,从而增强PAX4表达以在内分泌谱系定向过程中采用β细胞命运(PubMed:35798741)。在DNA低甲基化条件下,例如在雌性减数分裂生殖细胞中,可能诱导着丝粒周围异染色质(PCH)的表观遗传重编程,即着丝粒周围区域的组成型异染色质。PCH在间期细胞核中形成染色中心,染色中心在减数分裂前期聚集。在此背景下,对于染色中心的聚集也可能是必不可少的,这种方式不依赖于催化活性,可能是通过将聚合酶抑制性复合物1(PRC1)招募到染色中心(By similarity)。在胚胎发育过程中,可能为卵母细胞的正常减数分裂进程和减数分裂基因激活所必需(By similarity)。优先结合含有胞嘧啶-磷酸-鸟嘌呤(CpG)二核苷酸的DNA,而非CpH(H=A、T和C)、半甲基化CpG和半甲基化羟甲基CpG(PubMed:29276034)。{ECO:0000250|UniProtKB:Q3URK3, ECO:0000269|PubMed:12124344, ECO:0000269|PubMed:19372391, ECO:0000269|PubMed:19372393, ECO:0000269|PubMed:21496894, ECO:0000269|PubMed:21778364, ECO:0000269|PubMed:25284789, ECO:0000269|PubMed:29276034, ECO:0000269|PubMed:31278917, ECO:0000269|PubMed:33833093, ECO:0000269|PubMed:35798741}.; FUNCTION: [Isoform 1]: 双加氧酶,在活性DNA去甲基化中发挥关键作用(PubMed:28531272)。结合启动子,特别是那些具有高CG含量的启动子(By similarity)。在海马神经元中,与Isoform 2相比,Isoform 1调节独特子集基因的表达,尽管两种亚型之间存在一些重叠,因此差异性地调节兴奋性突触传递(By similarity)。在海马神经元细胞培养物中,Isoform 1控制微小兴奋性突触后电流的幅度和频率(By similarity)。Isoform 1可能调节涉及海马依赖性记忆的基因,导致记忆的正向调节,与可能降低记忆的Isoform 2相反(By similarity)。{ECO:0000250|UniProtKB:Q3URK3, ECO:0000269|PubMed:28531272}.; FUNCTION: [Isoform 2]: 双加氧酶,在活性DNA去甲基化中发挥关键作用(PubMed:28531272)。与Isoform 1一样,结合启动子,特别是那些具有高CG含量的启动子,然而与Isoform 1相比,其整体染色质亲和力降低,导致与Isoform 1相比整体DNA去甲基化减少(By similarity)。与Isoform 1相反,Isoform 2在S期定位于异染色质中正在进行DNA复制的位点,导致显著的从头5hmC形成,整体上如此,在异染色质中更是如此,包括LINE 1散在DNA重复序列,导致其激活(By similarity)。在海马神经元中,与Isoform 1相比,Isoform 2调节独特子集基因的表达,尽管两种亚型之间存在一些重叠,因此差异性地调节兴奋性突触传递(By similarity)。在海马神经元细胞培养物中,Isoform 2控制微小兴奋性突触后电流的频率,但不控制幅度(By similarity)。Isoform 2可能调节涉及海马依赖性记忆的基因,导致记忆的负向调节,与可能改善记忆的Isoform 1相反(By similarity)。在未成熟和部分分化的促性腺激素细胞中,直接抑制黄体生成素基因LHB表达,并且不在基因启动子处催化5hmC(By similarity)。{ECO:0000250|UniProtKB:Q3URK3, ECO:0000269|PubMed:28531272}.

组织特异性

Expressed in fetal heart, lung and brain, and in adult skeletal muscle, thymus and ovary. Not detected in adult heart, lung or brain. Up-regulated in glioblastoma cells (at protein level) (PubMed:25284789).

亚细胞定位

Nucleus

关键词

3D-structure Activator Alternative promoter usage Alternative splicing Chromatin regulator Chromosomal rearrangement Chromosome Developmental protein Dioxygenase DNA-binding