POLR2A P24928

DNA导向RNA聚合酶II亚基RPB1 (RNA聚合酶II亚基B1) (EC 2.7.7.6) (3'-5'核糖核酸外切酶) (EC 3.1.13.-) (DNA导向RNA聚合酶II亚基A) (DNA导向RNA聚合酶III最大亚基) (RNA导向RNA聚合酶II亚基RPB1) (EC 2.7.7.48)

功能描述

RNA polymerase II (Pol II)的催化核心组分，Pol II是一种DNA依赖性RNA聚合酶，以四种核糖核苷三磷酸为底物合成mRNA前体和许多功能性非编码RNA (By similarity) (PubMed:23748380, PubMed:27193682, PubMed:30190596, PubMed:9852112)。Pol II介导的转录循环经历转录起始、转录延伸和转录终止阶段。在转录起始过程中，Pol II前起始复合物 (PIC) 被募集到DNA启动子，其中聚焦型启动子含有起始子 (Inr) 元件或在细胞类型特异性基因中发现的TATA框，而分散型启动子通常含有低甲基化CpG岛，常见于管家基因。一旦聚合酶从启动子逃逸，它就进入延伸阶段，在此阶段基于与模板DNA链的互补性，RNA被主动聚合。转录终止涉及RNA转录本和聚合酶从DNA上的释放 (By similarity) (PubMed:23748380, PubMed:27193682, PubMed:28108474, PubMed:30190596, PubMed:9852112)。与第二大亚基POLR2B/RPB2共同形成Pol II活性中心。逐个核苷酸添加到新生RNA的3'端，其中POLR2A/RPB1最可能贡献一个Mg(2+)配位的DxDGD基序，而POLR2B/RPB2参与第二个Mg(2+)离子的配位并提供被认为促进进入的核苷酸与模板碱基之间Watson-Crick碱基配对的赖氨酸残基。通常，Mg(2+)离子引导5'核苷三磷酸与新生RNA前一个核苷酸的3'羟基形成磷酸二酯键，并消除焦磷酸。可逆的焦磷酸解反应可在高浓度焦磷酸下发生 (By similarity) (PubMed:30190596, PubMed:8381534, PubMed:9852112)。可以通过3' -> 5'核酸外切酶活性校对新生的RNA转录本。如果错误掺入了一个核糖核苷酸，则会沿着模板DNA回溯并切断磷酸二酯键，释放错误掺入的5'-核糖核苷酸 (By similarity) (PubMed:8381534)。通过其独特的C末端结构域 (CTD，52个七肽串联重复) 作为组装调节转录起始、延伸和终止因子的平台。Ser-5上的CTD磷酸化介导Pol II启动子逃逸，而Ser-2上的磷酸化是转录延伸过程中Pol II暂停释放及进一步pre-mRNA加工所必需的。此外，基因表达水平的调节取决于CTD-赖氨酸的甲基化和乙酰化水平之间的平衡。生长因子诱导的即刻早期基因的转录起始或早期延伸步骤受CTD乙酰化状态的调节。甲基化和二甲基化对靶基因表达有抑制作用。与mRNA剪接机制协作，参与pre-mRNA的共转录5'-端加帽和共转录剪接 (By similarity) (PubMed:24207025, PubMed:26124092)。 {ECO:0000250|UniProtKB:G3MZY8, ECO:0000250|UniProtKB:P08775, ECO:0000269|PubMed:23748380, ECO:0000269|PubMed:24207025, ECO:0000269|PubMed:26124092, ECO:0000269|PubMed:27193682, ECO:0000269|PubMed:28108474, ECO:0000269|PubMed:30190596, ECO:0000269|PubMed:8381534, ECO:0000269|PubMed:9852112}.; FUNCTION: RNA依赖性RNA聚合酶，以四种核糖核苷三磷酸为底物，催化非编码RNA (ncRNA) 3'端的延伸。靠近3'端的内部ncRNA序列在单轮Pol II介导的RNA聚合反应中充当模板。可能降低抑制Pol II介导的基因转录的ncRNAs的稳定性。 {ECO:0000269|PubMed:23395899}.; FUNCTION: (Microbial infection) 当与乙型肝炎病毒的小delta抗原结合时，作为RNA依赖性RNA聚合酶，既作为病毒RNA环状基因组的复制酶又作为转录酶。 {ECO:0000269|PubMed:18032511}.

亚细胞定位

Nucleus