剪接体RNA解旋酶DDX39B (EC 3.6.4.13) (56 kDa U2AF65相关蛋白) (ATP依赖性RNA解旋酶p47) (DEAD盒蛋白UAP56) (HLA-B相关转录本1蛋白)
剪接体RNA解旋酶DDX39B (EC 3.6.4.13) (56 kDa U2AF65相关蛋白) (ATP依赖性RNA解旋酶p47) (DEAD盒蛋白UAP56) (HLA-B相关转录本1蛋白)
Q13838功能描述
参与剪接和未剪接mRNA的核输出 (PubMed:15833825, PubMed:15998806, PubMed:17190602)。TREX复合物的组分，该复合物被认为偶联mRNA转录、加工和核输出，并特异性与剪接mRNA结合，而不与未剪接pre-mRNA结合 (PubMed:15833825, PubMed:15998806, PubMed:17190602)。TREX复合物通过不依赖转录的机制被募集到剪接mRNA，结合于外显子连接复合物(EJC)上游的mRNA，并以依赖剪接和帽依赖的方式被募集到mRNA 5'端附近的区域，在那里通过TAP/NXF1途径发挥mRNA输出至细胞质的功能 (PubMed:15833825, PubMed:15998806, PubMed:17190602)。仅THOC1-THOC2-THOC3核心复合物就足以促进DDX39B的ATP酶活性；在该复合物中，THOC2是唯一与DDX39B直接相互作用的组分 (PubMed:33191911)。与SARNP/CIP29结合，后者促进DDX39B的RNA结合，并可能在mRNA输出中发挥作用 (PubMed:37578863)。在TREX组装过程中可能经历数轮ATP水解，以驱动ALYREF/THOC4和CHTOP等组分随后加载到mRNA上。也与不依赖ALYREF/THOC4的pre-mRNA结合。参与无内含子mRNA的核输出；其ATP结合形式被认为将输出适配器ALYREF/THOC4募集到无内含子mRNA；其ATP酶活性受RNA和ALYREF/THOC4协同刺激，ATP水解被认为触发与RNA的解离，从而允许ALYREF/THOC4和NXF1-NXT1异二聚体的结合。参与转录延伸和基因组稳定性。 {ECO:0000269|PubMed:11675789, ECO:0000269|PubMed:15585580, ECO:0000269|PubMed:15833825, ECO:0000269|PubMed:15998806, ECO:0000269|PubMed:17190602, ECO:0000269|PubMed:17562711, ECO:0000269|PubMed:17984224, ECO:0000269|PubMed:20844015, ECO:0000269|PubMed:22144908, ECO:0000269|PubMed:23222130, ECO:0000269|PubMed:23299939, ECO:0000269|PubMed:33191911, ECO:0000269|PubMed:37578863, ECO:0000269|PubMed:9242493}.; FUNCTION: 剪接因子，为剪接体组装的第一个ATP依赖步骤以及U2 snRNP与分支点的相互作用所必需。具有RNA刺激的ATP结合/水解活性和ATP依赖的RNA解旋活性。即使有RNA的刺激，ATP酶活性仍然较弱。只能水解ATP而不能水解其他NTP。ATP酶活性的RNA刺激对RNA的序列和长度没有强烈的偏好。然而，ssRNA对ATP酶活性的刺激作用远强于dsRNA。在体外可以解开5'或3'突出端或平末端的RNA双链。ATP酶和解旋酶活性不受U2AF2影响；关于ALYREF/THOC4的影响报道不一，[PubMed:23299939]报道其具有刺激作用。 {ECO:0000269|PubMed:23299939, ECO:0000269|PubMed:9242493}.; FUNCTION: (微生物感染) TREX复合物对于卡波西肉瘤相关疱疹病毒(KSHV)无内含子mRNA的输出和传染性病毒的产生至关重要。 {ECO:0000269|PubMed:18974867}.
亚细胞定位
Nucleus. Nucleus speckle. Cytoplasm. Note=Can translocate to the cytoplasm in the presence of MX1. TREX complex assembly seems to occur in regions surrounding nuclear speckles known as perispeckles.
关键词